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2024-06-281615 次浏览
nest联手ai,发布类器官免费智能分析软件



gelnest organoid software是一款由耐思开发,可在离线状态下免费使用类器ai大模型分析软件。

它能批量、无标记分析由显微镜获取的类器官照片(不限显微镜品牌),帮助您更快、更准确的获得类器官的数量、大小(面积)、圆度、周长、灰度值(可统计荧光照片的不同类器官/细胞球的荧光强度,或明场照片的类器官亮度,从而反应类器官的死活状态)等参数,并生成统计分析结果。

分析结果提供所有识别出的类器官,并按大小降序进行编号,用户可根据个性化需求自定义类器官的大小范围,筛选符合的类器官分析数据。

另外,基于电脑的gpu配置选择不同权重包,能够实现用户对不同识别精度的要求。

软件链接即将上线耐思24848威尼斯官网,安装环境为带独立显卡的windows系统电脑。注:最低配置为 6g nvdia显卡

提取码:nest



软件特点:大批量 自定义 




批量处理文件夹内的所有类器官图片 
可自定义类器官大小的范围 ,像素推荐范围为500-300000
▪根据识别精度要求,和用户gpu配置,根据显卡大小(6g、12g、16g)自行选择权重包(小、中、大)
▪用户输入图片的实际长度(微米),统计表将自动换算为类器官实际面积大小(平方微米)




ai支持:强大的自主分析能力  




智能分析

01


▪4种识别呈现效果,用户可自选一种进行使用。


▪无论是空心的类器官,还是实心的类器官都能很好的识别分析


胆管类器官(空心)



脑类器官(实心)


数据处理

02


对每个类器官图形进行编号(类器官图形和编号对应,编号按照类器官大小降序排列)


▪analyse统计结果文件:

id类器官编号

area(square pixels)类器官图形的面积,单位为像素值的平方

proportion类器官面积与整张图片面积的比值

perimeter(square pixels)每个类器官的周长,单位为像素值

circularity每个类器官的圆度,单位为像素值

area(micron)类器官的实际大小,单位为平方微米

perimeter(square pixels)每个类器官的周长,单位为微米

circularity每个类器官的圆度,单位为微米



summary统计结果文件:

整张图片类器官总数,以及各参数的平均值



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